Mirando en the Bakery de CakePHP he encontrado una librería genial tanto para JQuery como para prototype, para cargar imagenes con AJAX.
Es francamente sencilla de utilizar, y además podemos conseguir unos acabados muy al estilo de web 2.0. eliminando de una vez por todas el input.file de toda la vida que a mi parecer es horroroso.
Podéis encontrar el articulo original aquí.